Le site de l'étang de La Capelle est constitué d'une mosaïque d'habitats, allant de l'eau libre à la forêt, répartis essentiellement en fonction de la quantité
d'eau dans le sol.
Ici, le paysage est cerné par une ligne de crête qui délimite le bassin versant de l'étang.
Sur les pentes, la garrigue ainsi que les terres agricoles et les prairies sèches culminent à 200 mètres d'altitude. Plus on s'approche de l'étang, plus l'humidité augmente, et l'on retrouve des forêts galeries, des prairies humides, des roselières et les végétations aquatiques.
La végétation des mares temporaires amphibies, que l'on appelle "Gazons amphibies méditerranéens", est un habitat prioritaire au titre de la directive européenne "Habitat-Faune-Flore" de Natura 2000. Cet habitat localisé sur l'étang et ses mares abrite un cortège exceptionnel de plantes patrimoniales, dont cinq espèces protégées au niveau national et une au niveau régional.
Les gazons amphibies méditerranéens constituent "l'enjeu habitat" majeur du site, au vu de sa classification, de sa richesse floristique et des surfaces importantes qu'il recouvre (deux hectares).
Trois autres habitats inféodés aux zones humides ont été identifiés sur le site :
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